Systém hub
Říše: Chromista (syn. Stramenopila, Straminipila)
- Odd. Labyrinthulomycota
- Tř. Labyrinthulomycetes
- Tř. Thrastochytriomycetes
- Odd. Oomycota (syn. Peronosporomycota) – houby vaječné
- Odd. Hyphochytriomycota
Říše: Fungi – houby
- Odd. Chytridiomycota – houby buněnkotvaré
- Tř. Chytridiomycetes
- ř. Chytridiales
- ř. Spizellomycetales
- ř. Blastocladiales
- ř. Monoblepharidales
- Odd. Microsporidiomycota – mikrosporidie
- Odd. Eumycota – pravé houby
- Pododd. Zygomycotina – houby spájivé
- Tř. Zygomycetes
- ř. Mucorales
- ř. Endogonales
- ř. Glomales
- ř. Entomophthorales
- ř. Zoopagales
- ř. Dimargaritales
- ř. Kickxellales
- Tř. Trichomycetes
- Pododd. Ascomycotina – houby vřeckaté
- Tř. Hemiascomycetes
- ř. Saccharomycetales
- ř. Schizosaccharomycetales
- ř. Protomycetales
- ř. Taphrinales
- Tř. Ascomycetes – houby vřeckovýtrusé
- ř. Laboulbeniales
- ř. Eurotiales
- ř. Pezizales
- ř. Erysiphales
- ř. Helotiales
- ř. Rhytismatales
- ř. Hypocreales
- ř. Microascales
- ř. Diaporthales
- ř. Ophiostomatales
- ř. Sordariales
- ř. Boliniales
- ř. Xylariales
- ř. Diatrypales
- ř. Phyllachorales
- ř. Dothideales
- ř. Pleosporales
- ř. Lecanorales
- ř. Lichinales
- ř. Arthoniales
- ř. Gyalectales
- ř. Ostropales
- ř. Verrucariales
- Pomocné pododd. Deuteromycotina – houby nedokonalé (Fungi imperfecti)
- Pododd. Basidiomycotina – houby stopkovýtrusé
- Tř. Heterobasidiomycetes
- ř. Uredinales
- ř. Ustilaginales
- ř. Exobasidiales
- ř. Tilletiales
- ř. Tremellales
- ř. Auriculariales
- ř. Dacrymycetales
- Tř. Homobasidiomycetes
- Podtř. Hymenomycetidae
- ř. Aphyllophorales
- ř. Cantharellales
- ř. Polyporales
- ř. Russulales
- ř. Hymenochaetales
- ř. Boletales
- ř. Agaricales
- ř. Thelephorales
- Podtř. Gasteromycetidae
- ř. Lycoperdales
- ř. Geastrales
- ř. Sclerodermatales
- ř. Nidulariales
- ř. Phallales